Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Rapgef3Q8VCC8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Rapgef3Q8VCC8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Rapgef3Q8VCC8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rapgef3Q8VCC8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef3Q8VCC8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms