Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clptm1Q8VBZ3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clptm1Q8VBZ3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms