Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ApobrQ8VBT6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ApobrQ8VBT6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms