Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ccdc58Q8R3Q6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc58Q8R3Q6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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