Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slf1Q8R3P9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slf1Q8R3P9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms