Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3B7

Brd8, Bromodomain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd8Q8R3B7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Brd8Q8R3B7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Brd8Q8R3B7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms