Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClmpQ8R373 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmpQ8R373 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmpQ8R373 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmpQ8R373 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmpQ8R373 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmpQ8R373 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmpQ8R373 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmpQ8R373 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmpQ8R373 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmpQ8R373 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmpQ8R373 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms