Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Hoxc12Q8K5B8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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