Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpv3Q8K424 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms