Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3X6

Anks4b, Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anks4bQ8K3X6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Anks4bQ8K3X6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Anks4bQ8K3X6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Anks4bQ8K3X6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Anks4bQ8K3X6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Anks4bQ8K3X6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Anks4bQ8K3X6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Anks4bQ8K3X6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Anks4bQ8K3X6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Anks4bQ8K3X6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Anks4bQ8K3X6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Anks4bQ8K3X6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Anks4bQ8K3X6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Anks4bQ8K3X6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Anks4bQ8K3X6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Anks4bQ8K3X6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Anks4bQ8K3X6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Anks4bQ8K3X6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms