Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nsl1Q8K305 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nsl1Q8K305 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms