Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf39Q8K2Z2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms