Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Paf1Q8K2T8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Paf1Q8K2T8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms