Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brd3Q8K2F0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brd3Q8K2F0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms