Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hacd3Q8K2C9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hacd3Q8K2C9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms