Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcho1Q8K285 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcho1Q8K285 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms