Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf3c1Q8K284 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c1Q8K284 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms