Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkd3Q8K1Y2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms