Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1D0

Gm42417, Ankrd23 protein, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42417Q8K1D0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm42417Q8K1D0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms