Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CopaQ8CIE6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms