Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ep400Q8CHI8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms