Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Upp2Q8CGR7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms