Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGK6

Ifnl3, Interferon lambda-3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnl3Q8CGK6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms