Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cdc34Q8CFI2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdc34Q8CFI2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdc34Q8CFI2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdc34Q8CFI2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdc34Q8CFI2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdc34Q8CFI2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdc34Q8CFI2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cdc34Q8CFI2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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