Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh13Q8CEE7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh13Q8CEE7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms