Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkiras1Q8CEC5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms