Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc17Q8CE13 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms