Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDU5

Efhb, EF-hand domain-containing family member B, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EfhbQ8CDU5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EfhbQ8CDU5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms