Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrrc9Q8CDN9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc9Q8CDN9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms