Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atad2Q8CDM1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms