Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Lrif1Q8CDD9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrif1Q8CDD9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrif1Q8CDD9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrif1Q8CDD9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lrif1Q8CDD9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lrif1Q8CDD9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Lrif1Q8CDD9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrif1Q8CDD9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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