Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Samd4aQ8CBY1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Samd4aQ8CBY1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Samd4aQ8CBY1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Samd4aQ8CBY1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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