Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nrip1Q8CBD1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms