Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slfn5Q8CBA2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slfn5Q8CBA2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms