Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fbxo48Q8CAT8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fbxo48Q8CAT8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms