Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Atg4aQ8C9S8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
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Atg4aQ8C9S8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Atg4aQ8C9S8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Atg4aQ8C9S8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Atg4aQ8C9S8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Atg4aQ8C9S8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Atg4aQ8C9S8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Atg4aQ8C9S8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Atg4aQ8C9S8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Atg4aQ8C9S8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Atg4aQ8C9S8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Atg4aQ8C9S8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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Atg4aQ8C9S8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4aQ8C9S8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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