Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ppfibp1Q8C8U0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms