Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

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Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Col6a6Q8C6K9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Col6a6Q8C6K9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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