Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bhlhe22Q8C6A8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bhlhe22Q8C6A8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms