Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cwc22Q8C5N3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cwc22Q8C5N3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms