Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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FarsaQ8C0C7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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FarsaQ8C0C7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FarsaQ8C0C7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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