Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Iffo1Q8BXL9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Iffo1Q8BXL9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Iffo1Q8BXL9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Iffo1Q8BXL9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Iffo1Q8BXL9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Iffo1Q8BXL9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Iffo1Q8BXL9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Iffo1Q8BXL9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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