Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX10

Pgam5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgam5Q8BX10 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pgam5Q8BX10 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgam5Q8BX10 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgam5Q8BX10 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgam5Q8BX10 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pgam5Q8BX10 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pgam5Q8BX10 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pgam5Q8BX10 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Pgam5Q8BX10 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pgam5Q8BX10 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pgam5Q8BX10 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pgam5Q8BX10 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pgam5Q8BX10 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pgam5Q8BX10 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pgam5Q8BX10 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Pgam5Q8BX10 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Pgam5Q8BX10 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Pgam5Q8BX10 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pgam5Q8BX10 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Pgam5Q8BX10 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms