Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ctdsp2Q8BX07 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ctdsp2Q8BX07 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ctdsp2Q8BX07 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ctdsp2Q8BX07 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ctdsp2Q8BX07 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctdsp2Q8BX07 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ctdsp2Q8BX07 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
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Ctdsp2Q8BX07 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ctdsp2Q8BX07 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ctdsp2Q8BX07 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ctdsp2Q8BX07 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ctdsp2Q8BX07 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ctdsp2Q8BX07 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ctdsp2Q8BX07 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ctdsp2Q8BX07 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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