Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40Q8BWR4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Usp40Q8BWR4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Usp40Q8BWR4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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