Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp38Q8BW70 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Usp38Q8BW70 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp38Q8BW70 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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