Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Als2cr12Q8BVM7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Als2cr12Q8BVM7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms