Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nup54Q8BTS4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms