Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQU3

Sdhaf3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf3Q8BQU3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdhaf3Q8BQU3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sdhaf3Q8BQU3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms