Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Grik4Q8BMF5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Grik4Q8BMF5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms